สวนญี่ปุ่นจัดแสดงภูมิประเทศ ซึ่งรวมถึงภูเขาไฟฟูจิจำลอง สูง 3 เมตร หุบเขาหมอกคิริตานิ เกาะเต่า ซึ่งเป็นสัญลักษณ์แห่งอายุวัฒนะ เกาะนกกระเรียน ซึ่งเป็นสัญลักษณ์แห่งโชคลาภ

จุดเด่นของสวนญี่ปุ่นอยู่ที่ “บัวโอกะ” ซึ่งถูกปลุกขึ้นจากเมล็ดอายุ 2,000 ปี ในฟอสซิลที่วัดชิบะ โดย อิจิโร โอกะ เมื่อปี 2494 สวนญี่ปุ่นยังเป็นเครื่องหมายบ่งบอกถึงวาระครบรอบ 120 ปี ของการสถาปนาความสัมพันธ์ทางการทูตของญี่ปุ่น-ไทย อีกด้วย